アキシマクジラの化石は、昭和３６年（１９６１年）８月２０日、八高線多摩川鉄橋の橋脚番号１１の下流３６メートルの地点から、ほぼ完全な形で発見されました。 化石の全長は１６メートル、ヒゲクジラの仲間でコククジラに近い種類ですが、現在のクジラと異なることから、「アキシマクジラ」と命名されました。 化石の年代については、当時、アキシマクジラが埋没していた地層から約５００万年前のものと推定されましたが、地質学の進歩により、現在では、新生代の第四紀の更新世の前期のもので、今から約１６０万年前の化石とされています。 現在、この化石は国立科学博物館新宿分館に保管されていますが、このうちの一部（胸椎と上腕骨）は、市役所１階のロビーに展示されています。 
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